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意味わかる方いたら教えてください

0 名前：まあ：2017/09/10 10:07

パートで働いています。
先日給料日で、明細書（本社発行）と上司が作成している進捗状況書（営業所発行）をもらいました。
明細書には有休分の計算もされ問題はないのですが、上司が勝手に作成している進捗状況書には有休分の計算がされておらず、12000円も少なく計算されてました。
今日、「間違えているから訂正して欲しい」と伝えたら、「みなさん、それぞれ時給が違うから仕方ないんですよ。有休手当ても金額違うし。年度末に調整しますから。」と言われました。
進捗状況が間違えていると、勤務時間が足らないとこの上司が嫌味を言って来るから、訂正してくださいと言っただけなんですよね。
上司が言った意味がわからないのですが、わかる方いますか？どんな意味だと思いますか？